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경향신문
2016년 11월 10일
고려대학교 강재우 교수 연구팀, 암치료에 새 희망 쏘다
맞춤형 항암제 조합 알고리즘 개발... 드림챌린지 세계 최상위권 랭크

고려대학교 강재우 교수(컴퓨터학과) 연구팀이 생명의료 국제경진대회 ‘드림챌린지’에서 스탠포드 등 세계 정상급 대학 경쟁팀들을 꺾고 상위 3%에 해당하는 최상위권의 성적을 거뒀다.

'드림챌린지’는 전 세계 연구자들과 경쟁을 통해 생명의료 관련 문제를 풀고자 하는 비영리 집단지성 연구단체로 드림챌린지에 참여하는 전 세계 연구팀들은 주어진 데이터와 조건 아래에서 성적을 겨룬다.

이번 대회에서는 세계 10대 다국적 제약회사 아스트라제네카(AstraZeneca)와 세계 최대 유전체 연구소인 생어 연구소(Sanger Institute)가 데이터를 제공하고 암 환자에게 어떤 항암제를 조합해 투약해야 가장 효과적일지를 예측하는 3가지 문제를 출제했다.

암 환자마다 발병원인이 다르고 그로 인한 항암제의 치료효과도 환자마다 다르다. 따라서 환자의 유전적 특성에 맞는 개인화된 처방을 받지만 단일 항암제에 대한 저항성으로 인해 많은 환자들이 시간이 지나면서 치료효과 감소와 암 재발을 겪는다.

정밀의료의 핵심과제는 항암제의 저항성 해결과 치료효과를 극대화 할 수 있도록 여러 항암제를 동시 투약하는 병합치료다. 환자 한 명이 가지는 방대한 양의 유전체 데이터와 수백 개의 항암제의 특성을 분석하는 것이 쉽지 않아 난이도가 높은 문제다.

강재우 교수 연구팀이 만든 알고리즘은 암 환자에 대해 다양한 항암제 조합들의 치료 효과를 예측하고 이를 바탕으로 최적의 조합을 추천한다. 이 과정에서 ‘기계학습’ 기술을 적용해 알고리즘이 스스로 학습하도록 했다. 또 수백만 편의 생명의료 문헌들로부터 자동으로 추출한 정보를 이용하여 보다 ‘똑똑한’ 인공지능을 구축하는 데 성공했다.

강재우 교수는 “최신 기계학습 기술을 빅데이터와 접목시켜 의학 분야에서 실질적인 문제를 풀어낸 것”이라며 “항암제 조합의 치료 효과를 예측하는 이번 연구가 약물 저항성과 재발에 대한 이해와 더불어 암 치료율 제고로 이어지기를 기대한다”고 말했다.

강재우 교수 연구팀(전민지, 김선규, 박성준, 이희원, 장혁윤, 유민환, 최광훈)은 전원 컴퓨터과학도로 구성된 팀인데도 드림챌린지에 참여한 70여개의 세계 정상급 연구팀과 경쟁해 3가지 문제에서 각각 2등에서 4등사이의 성과를 거뒀다. 동 대회에서 스탠포드팀은 7위, MIT팀은 13위에 랭크됐다. (* 첫번째 문제 기준)

또 강재우 교수 연구팀은 이번 연구 결과를 11월 9일 미국 애리조나 주 피닉스에서 열리는RECOMB/ISCB학회(RSG with Dream)에서 발표하며 드림챌린지 경진대회 결과는 이 분야 최고 권위 학술지 Nature Biotechnology에 게재될 예정이다.
dream_team
prize
고려대학교 강재우 교수 연구팀
전민지 김선규 박성준 이희원 장혁윤 유민환 최광훈
세계 10대 제약회사 "AstraZeneca" 주최, 항암제 병합 치료의 효능을 예측하는 The AstraZeneca-Sanger Drug Combination Prediction Challenge에 참여하여 전 세계 62팀 중 Stanford University(6위), MIT(11위)를 제치고 2위 입상. (Subchallenge1-B 기준)
Subchallenge1-A: 4위(76팀 참가 Stanford University 7위, MIT 13위)
Subchallenge1-B: 2위(62팀 참가 Stanford University 6위, MIT 11위)
Subchallenge2: 4위(39팀 참가 Stanford University 8위, MIT 21위)
Bonus Challenge1: 1위, Bonus Challenge2: 2위
링크:https://www.synapse.org/#!Synapse:syn4231880/wiki/399673
dream_challenge_drug
고려대학교 강재우 교수 연구팀
박성준 신원호 전민지 이선원
생물학적 네트워크에서 질병에 연관된 모듈을 발굴하는 Disease Module Identification DREAM Challenge: Discover disease pathways in genomic networks 대회에 참여하여 전체 42팀 중 종합성적 공동2위 달성 (Stanford University 11위, University of Pennsylvania,Yale University 공동 18위).
Homology Network :1위
Cancer Network :3위
Protein-Protein Interaction Network :4위
링크:https://www.synapse.org/#!Synapse:syn6156761/wiki/407453
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